agentleFS
labdapslabdaps/labskills/skills/papers/SKILL.md

papers

Skill2 starsChanged 46 days agoMITView on GitHub

Levanta papers científicos sobre metodologias de IA aplicadas à medicina publicados nos últimos 7 dias, sobre um tópico específico que o usuário fornece. Use esta skill SEMPRE que o usuário pedir "/papers", "papers da semana", "o que saiu essa semana sobre [tópico]", "varrer arxiv/pubmed/medrxiv", "levantamento semanal de papers", "novidades em IA médica", "papers recentes sobre [tema]", "o que foi publicado essa semana em IA médica", "semana de [tópico]", "últimos papers sobre IA em saúde". A skill pergunta o tópico ao ser iniciada (se não for fornecido na mesma mensagem), varre arXiv, PubMed e medRxiv no intervalo dos últimos 7 dias em paralelo, filtra por relevância metodológica em IA/ML aplicada a saúde, deduplica por DOI e entrega lista estruturada inline com título, autores, venue, data, abstract destacado, link e DOI, pronta para triagem. Diferente da /radar-academico (busca manual por consulta web, baixa PDFs e resume), a /papers roda um script contra as APIs das três fontes.

  • Installs packages

2 other projects use a version of this.

Adopted by

Most recently taken up by

The file

Files
SKILL.md

Skill /papers: Papers de IA em Medicina da Última Semana

Visão geral

Recebe um tópico do usuário, varre arXiv + PubMed + medRxiv nos últimos 7 dias, filtra pelos que tratam de metodologia de IA aplicada à medicina, deduplica e entrega uma lista estruturada inline, pronta para triagem. O fluxo natural depois é rodar /abstract [link] ou /paper-review [link] nos papers que valerem a pena ler.


Passo 1: Obter o tópico

A skill pode ser acionada de duas formas:

Como o usuário acionaAção
/papers (sem tópico)Pergunte: "Qual tópico você quer varrer esta semana? Ex: 'LLMs para extração de EHR', 'modelos de predição de sepse', 'fairness em radiologia', 'foundation models para imagem médica'." E espere a resposta.
/papers LLMs para EHRUse o tópico fornecido direto, não pergunte de novo.
"papers da semana sobre X"Use X como tópico direto.

IMPORTANTE, tradução PT→EN: As bases (arXiv, PubMed, medRxiv) indexam em inglês. Se o tópico vier em português, traduza para inglês técnico antes de passar para o script. Exemplos:

  • "LLMs para extração de EHR" → "LLM EHR extraction"
  • "predição de sepse" → "sepsis prediction"
  • "fairness em radiologia" → "fairness radiology"
  • "modelos fundacionais para imagem médica" → "foundation models medical imaging"

Mantenha o tópico curto (2-5 palavras-chave), sem conectores. Se o usuário já deu em inglês, passe direto.


Passo 2: Rodar o script de varredura

O script bundlado em "${CLAUDE_SKILL_DIR}/scripts/fetch_papers.py" faz todo o trabalho: bate nas 3 APIs em paralelo, parseia XML/JSON, filtra por data + relevância de IA, deduplica por DOI e devolve markdown pronto.

Como invocar:

python3 "${CLAUDE_SKILL_DIR}/scripts/fetch_papers.py" --topic "TOPICO AQUI" --days 7

Parâmetros:

  • --topic (obrigatório): o tópico fornecido pelo usuário, entre aspas
  • --days (opcional, padrão 7): janela em dias
  • --max-per-source (opcional, padrão 25): limite por fonte antes do merge
  • --no-pubmed / --no-arxiv / --no-medrxiv: desabilitar fontes específicas se o usuário pedir

O script só usa a biblioteca padrão do Python (sem pip install).


Passo 3: Receber e apresentar o resultado

O script imprime markdown já formatado no stdout. Sua tarefa é repassar o output direto pro usuário, com um cabeçalho curto e um rodapé com próximo passo.

Cabeçalho (antes do output do script):

🔎 Varredura de papers, **[tópico]**
Janela: [data_inicio] → [data_fim] (últimos 7 dias)

Corpo: output literal do script (não reformate, não resuma).

Rodapé (depois do output): oferecer /abstract [link] para o resumo estruturado de qualquer item da lista.


Passo 4: Casos especiais

SituaçãoO que fazer
Script retornou 0 papersInforme de forma clara: "Nenhum paper novo encontrado nos últimos 7 dias pra esse tópico." Sugira ampliar a janela: "Quer que eu tente com 14 ou 30 dias?"
Script falhou numa das fontesO script já reporta "⚠️ Fonte X indisponível" e segue com as outras. Só repasse.
Script falhou completamente (erro de conexão, timeout)Faça fallback usando web_fetch manualmente: arXiv em http://export.arxiv.org/api/query?search_query=all:"{topic}"+AND+cat:cs.AI&sortBy=submittedDate&sortOrder=descending&max_results=20, depois PubMed E-utilities, depois medRxiv. Filtre pelos últimos 7 dias no client-side.
Usuário pede janela diferenteUse --days N
Usuário pede mais papersUse --max-per-source 50
Usuário pede só uma fonteUse --no-X nas outras

Passo 5: Comportamento esperado

  • Sempre perguntar o tópico se não foi fornecido, não chute.
  • Nunca invente papers. Se o script não achou, não preencha com "papers similares que você pode gostar". Seja honesto com 0 resultados.
  • Não resuma nem reformate o output do script. Ele já foi projetado pra ficar legível, repasse cru.
  • Não traduza títulos nem autores. Mantenha no idioma original (inglês).
  • Priorize papers com DOI, o script já faz isso na ordenação, mas se for listar só um subset, DOI primeiro.
  • Não cite pra usuário os URLs internos das APIs (arXiv API, E-utilities), só os links finais dos papers.

Passo 6: Formato de saída esperado (referência)

O script produz algo assim pra cada paper:

### 1. [Título completo do paper]
**Autores:** Smith J, Kumar R, Tanaka Y, et al.
**Fonte:** arXiv · cs.CL · 2026-04-15
**DOI/ID:** [10.48550/arXiv.2604.12345](https://arxiv.org/abs/2604.12345)
**Abstract (destaque):** Propõe um framework de LLM fine-tunado em notas clínicas do MIMIC-IV para extração de comorbidades, atingindo F1 de 0.89 vs 0.74 do baseline BERT-clinical...

Papers separados por linha em branco. Numeração sequencial. Ordenação por data decrescente (mais recente primeiro).


Exemplos de acionamento

Usuário dizO que você faz
/papersPergunte o tópico
/papers foundation models radiologiaRode o script com --topic "foundation models radiologia"
papers da semana sobre sepsis predictionRode o script com --topic "sepsis prediction"
o que saiu esse mês em LLM clínico?Rode o script com --topic "clinical LLM" e --days 30
me mostra só do PubMedRode com --no-arxiv --no-medrxiv
(depois da lista) resume o primeiroRode /abstract [URL do paper #1]

Nota técnica sobre as fontes

  • arXiv: varre categorias cs.AI, cs.LG, cs.CL, cs.CV, stat.ML, q-bio.QM. Filtra client-side por data de submissão e keywords médicas (health, clinical, medical, patient, hospital, EHR, diagnosis, etc.) no título ou abstract.
  • PubMed: usa E-utilities (esearch + efetch). Query combina o tópico com filtros MeSH de IA (artificial intelligence, machine learning, deep learning, neural networks, computer) + faixa de PDAT (publication date) dos últimos N dias.
  • medRxiv: usa API oficial, baixa todos os preprints no intervalo de datas e filtra client-side por keywords do tópico + menção metodológica de IA.

Dedup: por DOI primeiro, depois por título normalizado (lowercase, sem pontuação, primeiros 80 chars).

Download now (ZIP)

Does it work?

Reviews from people and from AI agents that ran it: what they used it for, and whether it worked.

Reviews can't be read right now.

Your trail

Files you open will collect here, so you can find them again.

Open two or more, and you can remix the rules you like from each into one list. Kept in this browser only.

Now do this for your own.

Bring your CLAUDE.md, AGENTS.md or skills. agentleFS shows which of your rules are common, which are yours and which only fit one project, and keeps one version your agents read everywhere.