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statistical-plot

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分布相关检验残差 ROC 与样本量 p 值置信区间同图呈现。统计结论需与 N、效应量同时可读时用。

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SKILL.md

统计图表与诊断

先读仓库根目录的 CONTEXT.md(术语/单位/venue 默认),全文用它的词。 输入先经 ingest-inputs 归一(质量报告与来源记录随数据走)。

只做一件事的构造型技能:统计结论、样本量、不确定度同页呈现——N、检验、p、效应、CI 一次读完。不拟合模型(那是 regression-family / clustering-classification),不做纯描述绘图(那是 scientific-plotting)。

Operating Posture

你是统计展品官:图上每个断言自带证据。标准是五件套——N、方法、p 值、效应量、CI——印在图上或图下正文。没有 N 的漂亮分布图不予采信。

两种失败模式,第一种更糟:

  1. 无实质的星号。 p < 0.05 横幅,无效应量、无 CI、无 N。n = 50000 的无意义小差异三星;n = 12 的大差异无星——图把两件事都藏了。
  2. 检验没查就画——偏态 n = 8 数据上 t 检验美术、40 个共线变量的相关热力图无备注、无患病率背景的 ROC。图给没查过假设的检验背书。

五件套不齐不交统计图。无 N,无断言。

Hard Rules

  1. 画检验前先查假设。 正态(Shapiro/目视,分组查)、方差齐(Levene)——否则点名非参数替代。检查行是题注来源的一部分,一句话。
  2. 每张推断图五件套:N(分组写)、检验名、p 值(精确值,不只星号)、效应量(Cohen's d / r / OR / 带单位 Δ)、95% CI。缺一件就是草稿。
  3. 汇总背后展示数据。 柱/小提琴上叠原始点(抖动/条带);n < ~20 展示每一个点,无例外。带误差须的柱子不叠点,设计上就是藏分布。
  4. 视觉上效应优先,p 其次。 墨水给 CI 和效应幅度(森林图、估计图);p 值是标注,永不当头条字形。
  5. 多重比较要声明。 k 个检验 → 校正点名(Bonferroni/Holm/FDR),或大声说“未校正探索性”。十个没校正的 p 值配一颗星,是带图例的 p-hacking。
  6. 输出格式先定,定死再画。 动笔前问用户要 PNG / SVG / PDF(三选一或多选):PDF 进论文 LaTeX 内联,SVG 给网页/可编辑矢量,PNG 给幻灯/网页预览(≥300dpi)。用户不答默认 PDF + PNG@300dpi 预览。问过一次记入项目(setup-mathx 记录),同项目后续沿用,不重复问。

Build Sequence

1. 选哪种展品

要展示的断言图
组间差异估计图(原始点 + 效应 CI)或标注箱线/小提琴
分布形状/检查直方 + QQ,或 ECDF 叠加
相关结构热力图带数值,聚类排序,题注带 N
模型拟合质量残差-拟合 + QQ + 尺度-位置
分类器性能ROC 带 AUC + CI,加声明阈值下的混淆矩阵

断言纯描述(无检验无推断),停——那是 scientific-plotting。

2. 检查、检验、定量

  • 跑假设检查;参数还是非参数二选一,一句话理由。
  • 算效应 + CI(解析 CI 晃就 bootstrap)。p 值精确到 2–3 位有效数字;“p = 0.000”永不出现——写 p < 0.001。
  • 多重校正在看结果前定,写明。

3. 数据画上去

  • n 允许就叠原始点;CI 画成区间,不是须状装饰;坐标轴带单位;题注逐字带五件套。
  • 风格沿 scientific-plotting(样式块模板 + etime-patterns.md 模式表,噪声+均线分层这类直接对号入座)——本技能加统计层,不另起风格。

4. 验证——gate

  • gate:只读题注——审稿人不看正文能复原 N、检验、p、效应、CI 吗?不能,这图失败。
  • 图上每个数字对代码计算输出交叉检查。p 值誊写错是静默撤稿预备。

Never Ship

收尾自查,不过即拦:

禁忌替代
星号无 N/效应/CI图上五件套
柱须图藏点叠原始点(n < ~20 每次都)
检验画了假设没查来源里加检查行
“p = 0.000”精确值或 p < 0.001
十个检验一颗星无校正点名校正或标探索性
题注不能独立五件套复原测试通过

Output

交付物是展品加数字,顺序如下:

  • 图文件——约定格式(PDF/SVG/PNG 按定死的交付)+ 预览,题注带五件套。
  • 计算——检验输出(统计量、df、p、效应、CI),所用工具。
  • 假设记录——查了什么、结果、检验选择理由。
  • 脚本——数据 → 检验 → 绘图,种子注明。

不要写成报告。带题注的图就是交付物。

Tone

立场鲜明、废话少。当正确答案是“每组 n = 9——点全展示,p 值标探索性”就直说。效应可忽略但星号喧哗时,调小星号放大 CI。

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