项目工作规则

目标与权威

本项目采用证据驱动的 Stage 0–6 科研与论文流程。系统、开发者、用户当前请求及全局约定优先于本文件。阶段判据、Gate 与失败路由集中在 docs/WORKFLOW.md；本文件只保留常驻硬规则和读取入口。

新科研项目先按 README.md 的初始化说明检查目录与计划，在授权范围内建立项目骨架和所需技能，再填写启动信息。已有项目从 docs/00_start.md 及现有成果定位阶段，保留既有修改，只补必要缺项，不重复初始化或机械从 Stage 0 重跑；接续前核验当前阶段所需的前置条件。

每轮只读 docs/00_start.md 的当前状态、授权和下一步，再定位所需材料。长任务恢复或交接先按 00 的恢复核对确认下一动作与冻结目标、协议及版本一致。阶段不明或需要定位记录时查 docs/README.md；详细阶段与 Gate 判据按需查 docs/WORKFLOW.md。主控依全局协作规则选择直接执行、子代理、独立任务或聊天端辅助，本文件不复制模型名单和协作流程。

论文规划、完整起草、图题编辑和投稿检查按需读取 docs/WRITING_STANDARD.md。研究型论文默认七章：引言、相关工作、方法、数据与实验设置、实验结果、深入分析、结论；在 docs/09_paper_plan.md 实化逐章字数/图/表预算，依据当前用户要求、已批准结构及已核验期刊要求调整。规范内的参考稿计数和编辑经验不替代项目证据或现行期刊要求。

动态工具与技能

不要在项目文件里复制全局插件、应用或 MCP 清单。每项任务根据当前会话实际可调用的工具和全局能力路由选择入口；只在 docs/00_start.md 记录会阻碍本项目的能力缺口，不维护会过期的全局工具快照。

.agents/skills/ 保存项目级核心技能。使用 python tools/project.py list 查看随仓库发布的技能，使用 python tools/project.py add <project-path> --profile <profile> 按阶段补充。兼容其他助手时按 SETUP.md 使用原生目录适配或显式读取，先核验当前工具能力，不安装或修改全局配置。

证据与学术责任

不得编造引文、实验结果、审批、作者身份、数据许可、标准、期刊要求或已完成工作。AI 不是作者、证据来源或审批者；负责人确认研究问题、方法、实验计划、提升后的论断、结论和投稿决定。将重要论断关联到 docs/03_idea_report.md 的 Claim / Evidence ID，并回到一手来源核验。

确认针对需要决定的对象与版本，复用仍有效的批准；已批准范围内的实施细化、证据核验和普通编辑自主推进，不要求每阶段新增一条批准。实质改变目标、需要确认的论断提升、最终科学结论和投稿决定仍由负责人确认；执行或算力授权不替代学术签认。

区分观测结果、解释、假设和推测；保留负结果、未解决冲突及适用边界。原始和受限数据不可变；不得覆盖原始数据或就地修改支撑已报告结果的配置、检查点和实验记录。

授权与运行安全

付费计算、云资源创建或删除、远程进程操作、外部上传或发布、投稿、发送邮件及其他高影响操作，按当前全局规则和项目 docs/00_start.md 的授权执行。新增费用、对象、数据或权限范围时先取得相应授权。第三方模型仅按用户当前授权和全局外部模型咨询规则使用，发送最小脱敏上下文，其意见仍需核验。

开始昂贵训练前，完成数据审计、最小 smoke test、基线和停止规则、成本估计及所需授权。每次实际运行使用新的 Experiment ID，即使配置相同；配置、数据版本、划分、种子、代码、环境、硬件、命令、日志和输出登记在 experiments/registry/experiments.csv，并通过 state_path 引用运行器的原始状态。CSV 是统一运行台账，state.json 保留进程与产物事实；07 中的 active-run 是派生绑定，冲突处理遵循其规则。

目录与状态

当前阶段、下一 Gate、授权、阻塞和最小下一步只维护在 docs/00_start.md；实验统一登记在 experiments/registry/experiments.csv 并引用原始运行记录。公共台账及监督绑定由主任务或唯一调度者串行更新，执行者返回各自 Experiment ID 下的产物。docs/README.md 规定其他记录归属。experiments/ 是唯一远程计算边界，结果写入 results/。未经项目理由，不创建竞争的顶层 src、configs、scripts、tests、reports 或 artifacts。

阶段完成、运行启动或终态、阻塞及授权改变时，更新权威状态文件和对应阶段文档。详细 Gate 判据、阶段目标、运行监督与完成条件见 docs/WORKFLOW.md。