researchwrite — proposal-first 科研写作 pipeline

Additional configured journals

For Applied Soft Computing (ASC), Engineering Applications of Artificial Intelligence (EAAI), ISA Transactions, Knowledge-Based Systems (KBS), Measurement, Neurocomputing, or IEEE Transactions on Reliability, use ../nature-shared/journal-formats/index.md to resolve the exact journal. Preserve this skill’s task workflow and evidence safeguards. Apply only the selected reference’s relevant scope; do not impose flagship-Nature significance or import another journal’s numerical, citation, or production defaults. These seven profiles do not yet establish verified official submission limits; verify the target’s current official source when such requirements affect work.

ESWA journal context

When the target is Expert Systems with Applications (ESWA or Expert Syst. Appl., case-insensitive), read ../nature-shared/journal-formats/eswa.md before applying journal-specific defaults. Use the shared contract for a manuscript or publication plan explicitly targeting ESWA; record applicable constraints in the existing scope/style files. For empirical ML/RUL writing, also read ../nature-shared/core/eswa-ml-rul-style.md. Preserve proposal-mode deliverables when the user asks for a proposal; ESWA submission numbering and bibliography style do not change an unrelated proposal.

受 autonovel（状态机+打分）、professor（动态专家）、brainstorming（入口追问）、anti-AI-writing（语言清理）启发的科研写作状态机。不是通用"帮我写论文"prompt。

researchwrite 是为兼容既有安装保留的触发名称，仓库目录名仍为 nature-proposal-writer。不要在没有迁移方案时修改 frontmatter 名称。需要初始化模板、 按条件加载参考资料或执行导出脚本时，先读取 manifest.yaml，只加载与当前条件匹配的路径。

核心原则

1. 证据先于文字 — 起草前必须建立或读取 research_canon 和 evidence_table
2. 论证先于章节 — 写正文前必须完成 argument_map
3. 契约先于段落 — 每节需要 purpose / allowed claims / forbidden claims / inputs / validation
4. 范围先于完备 — 如果是分阶段写作，先锁定阶段边界
5. 动态专家，不设固定池 — 用 professor 按失败模式召唤对应专家
6. 内容先于语言 — 诊断科学逻辑后再做 anti-slop / 语言打磨
7. 不自动升级事实 — 永远不把 "may indicate" 改成 "proves"，除非有证据支撑
8. 删除胜于解释 — 当某主张不可行，直接删除。正文干净，解释留给答辩
9. 该停就停 — 平台期、专家冲突、证据缺失是停止理由，不是润色理由

模式分派

模糊时推断默认模式。只在选择会改变工作流时才问用户。

项目结构

工作目录：<outputs>/researchwrite/<project-slug>/

标准文件：

00_scope.md              写作任务边界
01_research_canon.md     硬事实和约束
02_evidence_table.md      claim → evidence 映射表
03_argument_map.md        论证架构
04_section_contracts.md   每节的 purpose / inputs / allowed & forbidden claims
05_style_guide.md         风格、术语、禁用表达
state.json                项目状态（mode、round、scores、technical_debts）
sources/                  用户材料、文献、数据
drafts/                   草稿和分节文件
revision_briefs/          修订简报
qa_logs/                  诊断、专家审查、anti-slop、打分记录
exports/                  最终输出（.md + .docx）

新建项目时按 manifest.yaml 的 templates.on_demand 路由从 templates/ 取空模板。 references/worked-example-quaternary-proposal.md 提供了基于通用材料科学领域的完整填写示例。

Reference 文件索引

完整 reference 按任务需要加载，不要一次性注入全部文件：

运行交付

每次运行结束时输出：

1. 当前文件路径或修订后文本
2. 当前分数/状态
3. 剩余风险
4. 一条建议的下一步

QA Mode — 四层质量保障 Pipeline

当用户说"审查这段/跑 QA/检查方案/过 pipeline"时，进入 QA 模式。

情境挡位

Pipeline 顺序（先内容后语言）

Gate 2: professor Convener（内容层）
  ├── 论文 → 方法论专家 + 领域专家
  ├── proposal → 可行性专家 + 创新性专家
  └── 文献综述 → 覆盖面专家 + 批判深度专家
  │
  ▼
Gate 1: avoid-ai-writing 模式 detect-only
  └── 只对英文有效，中文跳过或降级为手工扫读
  │
  ▼
Gate 3: auto-validation（格式/完整性层）
  └── 每个 claim 有 citation？方法可复现？编号连续？
  │
  ▼
Gate 4: 评分阈值（分维度打分）
  ├── 总分≥阈值 → 通过 ✅
  └── 总分<阈值 → 按低分维度定向回退（不超过 3 轮）

Gate 2 在 Gate 1 之前 — 避免改了句子后被专家打回重写。

使用方法

用户: "用 researchwrite 审查这段 discussion，paper 挡位"
  → 自动走 Gate 2 → Gate 1 → Gate 3 → Gate 4
  → 返回审查报告 + 定向修改建议

用户: "快速扫一下这个邮件"
  → 走 quick 挡位，只标记 P0 问题

配置你的研究域

首次使用告诉 agent 你的研究背景，agent 会调用 professor 建立领域专家知识。后续写作中专家审查会基于你的领域。