/paper-compile

编译 LaTeX 论文为 PDF，自动修复常见错误，验证提交要求。 输入 paper/ 目录（由 /paper-draft 生成），执行 latexmk 编译， 解析错误并尝试自动修复（缺失包、引用未定义、figure 路径）， 验证页数限制、匿名合规、字体嵌入、[UNCONFIRMED] 标记清除。 生成提交清单。

Inputs

• paper_dir（可选，默认 paper/）：LaTeX 项目目录，包含 main.tex
• --fix（可选）：启用自动修复模式（自动安装缺失包、修正路径）
• --checklist（可选）：生成详细提交清单（不编译，只检查）

Outputs

• paper/main.pdf — 编译后的 PDF
• COMPILE_REPORT（输出到终端）— 编译状态、检查结果、提交清单
• 若 --fix：修改的 .tex 文件（自动修复）

Wiki Interaction

Reads

• wiki/outputs/paper-plan-*.md — 获取 venue 信息（页数限制、匿名要求）
• .claude/skills/shared-references/citation-verification.md — [UNCONFIRMED] 标记检查规则

Writes

• paper/main.pdf — 编译输出
• wiki/log.md — 追加编译日志

Graph edges created

• 无

Workflow

前置：确认 paper/main.tex 存在。确认 latexmk 已安装（which latexmk）。

Step 1: 编译（Compile）

1. 首次编译：

   cd paper/ && latexmk -pdf -interaction=nonstopmode main.tex 2>&1

2. 解析编译输出：
   • 收集所有 errors（! ...）
   • 收集所有 warnings（Warning: / Overfull / Underfull）
   • 分类：
     • Missing package：! LaTeX Error: File 'xxx.sty' not found
     • Undefined reference：LaTeX Warning: Reference 'xxx' on page N undefined
     • Undefined citation：LaTeX Warning: Citation 'xxx' on page N undefined
     • Missing figure：! LaTeX Error: File 'figures/xxx' not found
     • Syntax error：其他 ! 开头的错误
     • Overfull/Underfull：排版警告（非阻塞）
3. 若编译成功（main.pdf 生成）：进入 Step 3
4. 若编译失败：进入 Step 2

Step 2: 自动修复（Auto-Fix）

若 --fix 启用，尝试自动修复每种错误类型：

2a. Missing package：

# 检查是否为 TeX Live 可安装包
tlmgr info {package-name} 2>/dev/null
# 若可安装且用户确认：
tlmgr install {package-name}

若无法安装：注释掉 \usepackage{xxx} 行并标注 % TODO: install package {xxx}

2b. Undefined reference/citation：

• Undefined reference：检查对应 \label{} 是否存在，若不存在则添加占位 label
• Undefined citation：检查 references.bib 是否包含该 key
  • 若不包含：尝试从 wiki papers 匹配并添加 [UNCONFIRMED] 条目
  • 若包含但 bibtex 未运行：重新运行 latexmk（通常 latexmk 自动处理）

2c. Missing figure：

• 检查 paper/figures/ 中是否存在不同扩展名的文件（.pdf vs .png vs .eps）
• 若找到：修正 \includegraphics 路径
• 若找不到：替换为占位符 \missingfigure{xxx}（需要 todonotes 包）

2d. Syntax error：

• 常见修复：未闭合的 {}、\begin{}/\end{} 不匹配、非法字符
• 尝试定位错误行号，提供具体修复建议
• 若无法自动修复：报告错误位置和建议

修复后重新编译（最多 3 轮 fix-compile 循环）：

cd paper/ && latexmk -pdf -interaction=nonstopmode main.tex 2>&1

Step 3: 验证检查（Verify）

编译成功后执行以下检查：

3a. 页数检查：

# 获取 PDF 页数
python3 -c "
import subprocess
result = subprocess.run(['pdfinfo', 'paper/main.pdf'], capture_output=True, text=True)
for line in result.stdout.splitlines():
    if line.startswith('Pages:'):
        print(line.split(':')[1].strip())
"

与 venue 页数限制对比（从 PAPER_PLAN 的 venue 或 academic-writing.md 的 venue 表获取）。

• 超限：报告超出页数，建议压缩或移至 appendix
• 不足：报告剩余空间，建议补充内容

3b. 匿名检查： 扫描所有 .tex 文件：

• 搜索作者姓名（若 \author{} 非空 → 警告）
• 搜索机构名（university, lab, institute → 警告）
• 搜索 GitHub/GitLab 链接（可能泄露身份 → 警告）
• 搜索 "our previous work" / "we previously" → 应使用第三人称引用
• 搜索 \thanks{} / \acknowledgments → 匿名提交应移除

3c. [UNCONFIRMED] 标记检查：

# 扫描 references.bib 和所有 .tex 文件
grep -rn "VERIFY" paper/

• 若存在 [UNCONFIRMED] 标记：列出每个，标注为 提交阻塞项
• 参照 citation-verification.md：[UNCONFIRMED] 是提交的硬阻塞

3d. 字体嵌入检查：

pdffonts paper/main.pdf

• 检查 "emb" 列：所有字体应为 "yes"
• 未嵌入字体：报告字体名，建议在编译选项中添加字体嵌入

3e. 内容完整性检查：

• 搜索 TODO、FIXME、XXX 标记
• 搜索 \missingfigure、空 section（\section{X} 后无内容）
• 搜索未引用的 figures/tables（\includegraphics 存在但无 \ref）
• 检查 abstract 是否存在且非空

Step 4: 生成提交清单和报告

# Compile Report

## Compilation
- Status: {SUCCESS / FAILED}
- Compiler: latexmk + pdflatex
- Rounds: {N} (including auto-fix rounds)
- Errors: {N} (fixed: {M}, remaining: {K})
- Warnings: {N} (overfull: {O}, underfull: {U}, other: {W})

## Verification Results

| Check | Status | Details |
|-------|--------|---------|
| Page count | {PASS/FAIL} | {N} pages (limit: {L}) |
| Anonymous | {PASS/WARN} | {details} |
| [UNCONFIRMED] citations | {PASS/FAIL} | {N} remaining |
| Fonts embedded | {PASS/FAIL} | {details} |
| No TODOs | {PASS/WARN} | {N} remaining |
| Figures referenced | {PASS/WARN} | {details} |
| Abstract present | {PASS/FAIL} | {details} |

## Submission Checklist

- [ ] PDF compiles without errors
- [ ] Page count within venue limit ({L} pages)
- [ ] All [UNCONFIRMED] citations resolved
- [ ] Anonymous submission (no author info)
- [ ] All fonts embedded
- [ ] No TODO/FIXME markers
- [ ] All figures referenced in text
- [ ] Abstract present and complete
- [ ] Supplementary material prepared (if applicable)
- [ ] Paper title matches submission system

## Blocking Issues
{list of FAIL items that must be resolved before submission}

## Warnings (non-blocking)
{list of WARN items for consideration}

## Next Steps
- {specific actions to resolve blocking issues}
- Run `/refine paper/main.tex --focus writing` for final polish
- Manual review of anonymous compliance

追加日志：

python3 tools/research_wiki.py log wiki/ \
  "paper-compile | {SUCCESS/FAILED} | {pages} pages, {errors} errors, {verify_count} [UNCONFIRMED], {checks_passed}/{checks_total} checks passed"

Constraints

• 不修改 wiki 内容：只操作 paper/ 目录和 wiki/log.md
• 自动修复需 --fix 启用：默认只报告错误不修复
• [UNCONFIRMED] 是硬阻塞：submission checklist 中 [UNCONFIRMED] 存在 = 不可提交
• 最多 3 轮 fix-compile：防止无限修复循环
• 不删除用户内容：auto-fix 只添加或修正，不删除用户手写的内容
• pdfinfo/pdffonts 依赖：若未安装，跳过对应检查并标注「tool not available」
• 匿名检查是启发式的：可能有 false positive，标注为 WARN 而非 FAIL

Error Handling

• main.tex 不存在：报错，建议先运行 /paper-draft
• latexmk 未安装：报错，提供安装命令（sudo apt install texlive-full 或 brew install --cask mactex）
• 编译失败且无法自动修复：输出完整错误日志 + 定位到具体 .tex 文件和行号
• pdfinfo/pdffonts 未安装：跳过页数/字体检查，在报告中标注
• PAPER_PLAN 找不到：跳过 venue 信息提取，使用默认限制（10 pages），警告用户
• 权限问题（tlmgr 需要 sudo）：报告需要手动安装的包列表

Dependencies

Tools（via Bash）

• latexmk — LaTeX 编译
• pdfinfo — PDF 页数检查（poppler-utils）
• pdffonts — 字体嵌入检查（poppler-utils）
• python3 tools/research_wiki.py log wiki/ "<message>" — 追加日志

MCP Servers

• 无

Claude Code Native

• Read — 读取 .tex 文件和编译日志
• Edit — 自动修复 .tex 文件（--fix 模式）
• Bash — 执行编译和检查命令
• Grep — 搜索 [UNCONFIRMED]、TODO、匿名违规

Shared References

• .claude/skills/shared-references/citation-verification.md — [UNCONFIRMED] 标记检查规则
• .claude/skills/shared-references/academic-writing.md — venue 页数限制参考

Called by

• /research Stage 5（论文编译阶段）
• 用户手动调用